Al despertar y encontrarse en una versión paralela de la ciudad de Fuyuki, Illyasviel "Illya" von Einzbern está perdida y sola. Descubre que su casa está en ruinas, con un enorme cráter en el centro de su ciudad natal. Con la nieve cayendo en pleno verano, la confusión consume a la joven estudiante de primaria, que no tiene idea de dónde pueden estar sus amigos o su varita Ruby.
Al llegar a los restos de su casa, de repente es abordada por una niña amnésica. ¿Dónde terminarán y cómo restaurará Illya el presente al mundo que una vez conoció?
